L'esclat de la Guerra Civil va buidar, literalment, la Model: els 859 presos que hi havia el 19 de juliol del 1936 van fugir davant el caos general a la ciutat. La derrota dels militars insurrectes, a Barcelona, va permetre que la Generalitat incautés el servei penitenciari el 12 d'agost i, tot seguit, el centre va començar a omplir-se de tots aquells individus sospitosos de ser desafectes a la República, classificats com a presoners "polítics".

Molts capellans i gent considerada "de dretes" hi van fer cap, com va ser el cas de mossèn Salvador Balletbó, capellà de Sant Fost de Campsentelles, que, després d'amagar-se al bosc mentre observava com els milicians de la CNT i la FAI incendiaven la rectoria i l'església del poble, va fugir cap a Barcelona, on podia passar desapercebut perquè ningú no el coneixia. Fins que, a l'abril del 1937, "representants governamentals" van registrar el pis on vivia mig ocult i el van detenir.

Va estar-se sis mesos a la Model, on, ben aviat, va coincidir amb els represaliats dels Fets de Maig: el centre va triplicar el nombre d'interns, fins arribar als 1.600 reclusos. Mossèn Balletbó va confessar haver-hi passat gana i rebut tota mena de maltractaments. Però el pitjor encara ho havia de viure: va sortir en llibertat al novembre, però van detenir-lo de nou quatre mesos més tard. I, aquest cop, el destí va ser la txeca de Vallmajor, on el grau de tortures que va rebre van ser d'una crueltat extrema.

Abans de tornar a ingressar a la Model, el maig del 1938, estarà retingut 25 dies al vapor 'Uruguai', acusat d'alta traïció. Un contrasentit, és clar: "Com podia delatar ningú jo que estava sempre amagat, sense veure mai ningú perquè no m'agafessin, com el conill que no es mou del cau perquè els caçadors no el disparin?". Va ser alliberat, definitivament, l'11 de juliol del 1938.